Através do parâmetro Renumera automaticamente quando duplicado você poderá configurar o sistema para renumerar o número do documento do Contas a Pagar sempre que você cadastrar um número existente.
Para configurar, acesse o módulo Financeiro, opção Tipos de Documento.
Selecione o tipo de documento desejado, marque a opção destacada abaixo e clique em Confirmar.
Para APs (Autorizações de Pagamento) geradas através de integrações ou nos módulos de Materiais e Distribuição o sistema não renumera o número do documento quando ocorre esse tipo de duplicidade. Nestes casos, o número continuará duplicado.